学院现有上海市智能网联汽车网络安全重点实验室、上海智能计算系统工程技术研究中心、上海市智能网联汽车网络安全产业协同创新中心等多个省部级重点实验室和工程研究中心。

上海市智能网联汽车网络安全重点实验室由上海大学与上海汽车集团股份有限公司联合共建，于2023年11月正式获批启动建设。实验室立足国家重大战略需求，聚焦智能网联汽车网络安全核心技术，重点围绕内生安全基础理论、一站式零部件网络安全检测、数据安全等关键方向开展科研攻关，以实现“网络威胁可防可抑、零部件可信可用、数据可管可控”为总体建设目标。实验室拥有一支高水平科研团队，由国家杰青、国家“万人计划”领军人才谢少荣教授担任主任，国家智能网联汽车重大专项专家组成员李玉峰教授担任执行主任，汇聚了包含国家级青年人才在内的40余名核心科研骨干。近年来，实验室科研成果显著，先后获批国家自然科学基金创新研究群体项目、荣获上海市技术发明奖一等奖；同时，联合上汽集团发布了“内生安全1.0系统”、“一站式安全检测平台”等重要成果，并正推进我国在智能网联汽车网络安全领域的首个ITU-T国际标准立项，持续为我国智能网联汽车产业的安全与高质量发展贡献力量。

上海智能计算系统工程技术研究中心依托上海大学，联合上海超级计算中心，于2019年经上海市科委正式批复成立。中心紧扣国家与上海市重大战略需求，致力于智能计算创新平台建设与关键共性技术攻关。其前身为上海大学高效能计算中心，历经二十余年建设与运营，现已形成超智融合异构算力调度、边缘智能计算、国产芯片测试与标准化三大核心研究方向，并构建了独具特色的产学研协同育人模式。共建单位上海超级计算中心历经三十余年发展积淀，为上海经济建设与社会发展提供了关键算力支撑，形成了高性能计算与智能计算平台规划、建设、管理及运营的核心能力与专业技术团队，具备完善的平台全生命周期运维及行业解决方案输出能力。自中心筹备与获批建设以来，上海大学与上海超级计算中心秉持优势互补、协同创新原则，围绕智能计算系统共性技术研发与智能应用基础研究两大主线，在行业解决方案输出、系统级方案研制、标准制定、人才实训培养及科普宣传推广等方面开展了一系列务实合作与成果转化。

上海市智能网联汽车网络安全产业协同创新中心是由上海大学牵头，联合奇安信集团、上汽集团、复旦大学和紫金山实验室共同组建的跨学科、跨行业科研平台。中心深入贯彻国家网络安全与汽车产业强国战略，聘请邬江兴院士担任首席科学家，构建了“政-产-学-研-用”五位一体的协同创新体系。中心紧密围绕智能网联汽车的电动化、智能化、网联化变革需求，重点攻克供应链安全分析、内生安全技术产业化、行业安全标准制定及高水平复合型人才培养等关键任务。通过自主研制自动驾驶广义鲁棒控制系统、建立原创漏洞库及推出前瞻性行业标准，中心致力于解决智能网联汽车领域的“卡脖子”安全难题，为上海市建设万亿级汽车产业集群提供核心技术支撑与安全保障。

此外，学院还建有上海大学城市信息研究中心、上海大学数据科学研究中心、上海大学高效能计算中心等校级科研机构，为有组织科研提供了坚实的平台支撑和高效的资源整合保障。