2004年自行研制建设完成的“自强3000”HP超级计算机共有192个节点机，384个计算核。2006年11月在系统生物学研究所建设了一台16个节点、64个计算核的IBM集群机。2008年3月在力学所和数学系分别建成一台16个节点、128个计算核的HP集群机。2013年建成的第三代集群式高性能计算机“自强4000”共有162个节点机，2480个计算核。2017年建设完成的大数据可视分析平台含有10个节点的高性能服务器集群、33个计算/渲染工作站集群、60块1080p窄边高清大屏。2018年中心新建成的机器学习平台共有4个KNL计算节点、2个FPGA节点、5个双GPU节点、一套4GPU的DGX-station、5个流式计算节点。至此，形成了以机器学习平台,大数据可视分析平台,“自强4000”超级计算机为主的计算基础设施平台。
依托计算机科学与技术学科，通过校内理、工、文、管、艺术等学科间交叉合作，凸现跨学科研究特色，推动学校重点学科项目的建设。中心建设立足于科学规划、系统建设、全面服务和形成特色，在强调计算服务质量和资源使用效率的同时，注重计算人才培养，提升上海大学高性能计算与应用的整体水平和上海大学的综合实力，最终建成上海大学高性能计算服务网格，使高效能计算中心进入国际知名、国内领先行列。
在高效能计算中心下，重点打造两支高性能计算与应用的技术队伍，即技术服务队伍和技术支撑队伍，聚焦高性能计算平台技术服务与高性能计算学科建设支撑。以科学研究支撑技术服务为出发点，以各学科对高性能计算的需求为驱动力，服务和推动相关学科发展，全面提升学校的整体科研实力，使高性能计算平台建设、高性能计算与应用研究、网格技术应用研究等在国际上占有一席之地。
通过建设，力争引进高性能计算系统管理、高性能计算与应用领域的知名专家2～3名，建成结构合理、富有创新精神的服务和研究团队，使得上海大学高效能计算中心在国内外具有较大的影响力。